Pembinaan sekolah ini bermula pada pertengahan Tahun 1937.Ianya telah dibina atas semangat gotong-royong serta kerjasama antara pemimpin-pemimpin dan penduduk-penduduk sekitar Kampung Kinarut.

Bangunan sekolah ini telah dirasmikan pada 1 hb Januari 1938 oleh D.K.Engle selaku Pegawai Daerah Papar.Encik Sujang Siaran adalah merupakan Guru Besar yang pertama sekali ditugaskan di sekolah ini dengan murid seramai 45 orang sahaja.

__________________________________________________________________________________________

PENGASAS SEKOLAH :

Sekolah Kebangsaan Pekan Kinarut yang asalnya Goverment Primary School ( GPS ) telah dibina pada tahun 1938. GPS telah ditukar kepada Sekolah Rendah Kebangsaan Pekan Kinarut ( SRK ) dan kemudian ditukar sekali lagi dengan nama Sekolah Kebangsaan ( SK ).

Semasa Perang Dunia Ke-2, sekolah ini telah ditutup dan kemudian di buka semula di bawah pemerintahan British pada tahun 1946. Pengasas sekolah ini ialah Allahyarham N.C.Sahal bin Datu Sulai. Ketika itu beliau bekerja dengan British Chartered Company dengan memegang jawatan sebagai Ketua Anak Negeri ( NC ). Beliau ditugaskan untuk membantu pihak kerajaan mengawal penduduk-penduduk yang tinggal di kawasan Tanaki, Gana dan Mandalipau.

Encik N.C.Sahal bin Datu Sulai adalah anak jati Kinarut yang berketurunan Bajau. Beliau mula bertugas pada tahun 1914 dan bersara pada tahun 1954. Beliau telah menaburkan khidmatnya kepada masyarakat selama 40 tahun dan meninggal dunia pada tahun 1970.

" Semoga Allah Mencucuri Rahmat Ke Atas Beliau..."

____________________________________________________________________________________________

SENARAI NAMA GURU-GURU BESAR

SEKOLAH KEBANGSAAN PEKAN KINARUT

BIL	NAMA GURU BESAR	TAHUN
1	ENCIK SUJANG SIARAN	1938-1939
2	ENCIK YUSUF LASIN	1940
3	ENCIK SUHAI GHANI	1940
4	ENCIK HAMZAH	1940-1941
5	ENCIK ABD GHANI PENDEK	1941
6	ENCIK DIN	1941-1943
7	ENCIK MAHMOOD	1944-1945
8	ENCIK ASLI LOTOH	1946-1947
9	ENCIK YUNUS	1947
10	ENCIK HARIS	1948
11	ENCIK PG ABDULLAH	1949-1954
12	ENCIK ABD GHANI PENDEK	1954
13	ENCIK MOHD YUNIN ARSHAD	1954-1957
14	ENCIK AG TUAH HJ OMAR	1957-1965
15	ENCIK MOHD YAKOB	1965-1967
16	ENCIK PAYUS MALUJIN	1967-1972
17	ENCIK PG MURSHID ABAS	1972-1975
18	ENCIK MATALI JAHIR	1975-1979
19	ENCIK HJ HAMDIN OSMAN	1979-1981
20	ENCIK SULAIMAN SUYAU	1981-1983
21	ENCIK KUI SHIN HAI	1983-1986
22	TUAN HJ MOHD TAHIR HJ LAJIM	1986-1990
23	ENCIK TAHIR OMAR	1990-1991
24	ENCIK JAILANI RIASIN	1991-1998
25	ENCIK YAKUB UTON	1998-2000
26	ENCIK MOHD ZAJIH HJ EDININ	20 OKT 2000 - 29 OGOS 2011
27	ENCIK BAKAR HJ TAHIR	19 SEPT 2011 - 28 JUN 2013
28	ENCIK SUNG  DIANA	09 SEPT 2013 - SEKARANG